Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

Un contrat doctoral de 36 mois est proposé au sein de l’unité MISTEA (INRAE Montpellier) pour concevoir un graphe de connaissances RDF dédié aux variables scientifiques en agroécologie, phénotypage et sciences de l’environnement, dans une perspective de science ouverte et d’interopérabilité. Ref :OT-26047.

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resume du projet du Contrat postdoctoral en INFORMATIQUE dans le cadre du projet INRAE

Les sciences agricoles et environnementales génèrent des données hétérogènes mesurant des variables scientifiques selon des formalismes et ontologies variés (OBOE, I-ADOPT, SSN/SOSA, Crop Ontology, etc.), ce qui limite leur interopérabilité. Le projet vise à créer un graphe de connaissances RDF unifié permettant de structurer, relier et interroger ces variables, tout en respectant la diversité des approches disciplinaires. Il s’inscrit dans la continuité des plateformes AgroPortal, EarthPortal et OpenSILEX/PHIS développées par INRAE, dans un cadre européen FAIR et collaboratif.

Durée du contrat doctoral en informatique a INRAE

Le contrat doctoral débutera en 2025 (date à préciser) pour une durée de 36 mois.

OBJECTIF du Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

Concevoir une modélisation unifiée des variables scientifiques, construire un graphe RDF interopérable, développer des outils d’exploitation basés sur les technologies sémantiques et les grands modèles de langage, et contribuer à la valorisation des données FAIR dans les domaines de l’agroécologie et du phénotypage.

MISSION ET RESPONSABILITES du Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

Le candidat sera chargé de : 

• Étudier et comparer les formalismes existants pour les propriétés observables;
• Modéliser et intégrer ces variables dans un graphe de connaissances RDF;
• Utiliser AgroPortal et autres portails pour enrichir le graphe;
• Déployer des méthodes d’apprentissage automatique sur graphes (PyKEEN, DGL-KE…);
• Prototyper une interface conversationnelle à base de LLM (type GPT);
• Travailler avec des jeux de données réels en phénotypage végétal;
• Participer aux publications scientifiques, aux validations et à la diffusion des résultats.

Profil recherché du Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

Le candidat doit avoir un Master ou diplôme d’ingénieur (Bac+5) en informatique, science des données, IA ou ingénierie des connaissances. Mais aussi :

• Connaître des technologies du web sémantique : OWL, RDF, SPARQL
• Avoir une sensibilité à la science ouverte, aux principes FAIR
• Capacités d’analyse, de rédaction scientifique, et maîtrise de l’anglais (français recommandé)
• Autonomie, rigueur, esprit d’initiative, mobilité nationale/internationale
• Expérience en données agricoles ou environnementales
• Connaissance d’outils comme AgroPortal, Protégé, OpenSILEX
• Notions de développement web ou dialogue IA.

CONDITIONS DE TRAVAIL du Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

• Lieu : INRAE Montpellier – Unité MISTEA
• Encadrement : Clément Jonquet (INRAE)
• Durée : 3 ans
• Rémunération : 2200€
• Équipe : 4 à 5 personnes dans un cadre interdisciplinaire européen
• Avantages :
  • 30 jours de congés + 15 RTT/an (temps plein)
  • Chèques-vacances, restauration collective
  • Soutien à la parentalité
  • Activités culturelles et sportives
  • Formations, accompagnement professionnel.

Candidature au Contrat doctoral en INFORMATIQUE A INRAE

Les candidatures doivent être soumises au plus tard le 30 septembre 2025, sous forme d’un dossier numérique.

Votre dossier de candidature doit impérativement comporter les éléments suivants :

• 01 curriculum vitae décrivant votre formation et votre expérience ;
• 01 lettre de motivation expliquant votre intérêt pour le sujet et votre adéquation avec le profil attendu ;
• des copies de vos diplômes les plus élevés et/ou autres certificats pertinents et/ou relevés de notes ;
• les noms et coordonnées de personnes référentes (enseignants, encadrants, responsables de stage, etc.).

Modalités d’envoi : Le dossier de candidature doit être envoyé uniquement au format numérique (.pdf)  à l’adresse suivante : clement.jonquet@inrae.fr

Des entretiens seront organisés à distance ou en présentiel. Plus d’informations seront transmises après contact.

Télécharger l'appel à candidature

Contacts

Pour tout renseignement, vous pouvez contacter :

• Responsable scientifique : Clément Jonquet – clement.jonquet@inrae.fr ;
• Site INRAE : https://www.inrae.fr

à propos de l’organisation

L’INRAE est l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, né de la fusion de l’Inra et d’Irstea en 2020, dont la mission est de produire et diffuser des connaissances scientifiques pour relever les défis sociétaux liés à ces domaines. Accéder au siteweb de l’INRAE.